Yayasan Betania Indonesia didirikan dengan tujuan untuk bersama mitra baik pemerintah maupun LSM/NGO's dalam dan luar negeri mengadakan :
- Pembinaan mental spiritual anak bangsa, khususnya mereka yang terabaikan karena status ekonomi, sosial budaya dan spiritual
- Melaksanakan Pendidikan Formal dan Informal
- Malaksanakan pelayanan kesehatan dengan menyediakan Klinik/Rumah Sakit, termasuk memberikan penyuluhan HIV / AIDS, bagi suku-suku / masyarakat terabaikan khususnya Komonitas Adat terpencil (KAT)
- Menjalankan kegiatan pengembangan masyarakat (CD) bagi masyarakat / suku-suku terabaikan, khususnya Komonitas Adat Terpencil (KAT)
- Mendirikan Panti Asuhan dan Panti lainnya sesuai kebutuhan.
- Menyediakan sarana transportasi darat, laut dan udara yang aman, ekonomis dan efesien.
​Usaha-usaha YBI yang sudah dikerjakan :
- Memberi pelatihan ketrampilan berupa kursus mengetik, jahit menjahit, dan masak-memasa kepada kelompok masyarakat di lokasi kegiatan Yayasan.
- Mengadakan pelatihan Managemen bagi Para Pemimpin Gereja dan Yayasan Lokal di Pedalaman Papua.
- Menyelenggarakan Lokakarya Pelatih Literasi ( Pemberatasan buta aksara )
- Membina jaringan Peduli Buta Aksara untuk Papua yang pada saat ini kurang lebih 50 anggota pelatih/tutor dan 45 kelompok belajar dewasa, berjmlah lebih 100 orang dewasa.
- Menyelenggarakan penyuluhan penyakit AIDS/HIV, Narkoba
- Mengadakan pelatihan kader Pos Obat Desa (POD) khususnya untuk 14 titik KAT di Papua
- Membantu membiayai anak-anak sekolah yang orang tuanya kurang mampu SD, SLTP dan SMU.
- Membantu masyarakat hasil-hasil bumi berupa kacang tanah, kayu gaharu, dari daerah KAT
- Mengadakan pendistribusian sembako dan kebutuhan rumah tangga ke daerah-daerah korban sosial yang disebabkan karena konflik agama, etnis dan bencana alam.
