Ditengah-tengah era globalisasi dan transformasi yang terjadi pada hampir seluruh aspek kehidupan bangsa Indonesia sejalan dengan pergerakan reformasi, namun tetap berlandaskan pada Ketuhanan Yang Maha Esa, dan Undang-undang Dasar 1945, maka pada hakekatnya oleh beberapa putra bangsa terbaik, dan bermoraal serta memiliki integritas dan kommitmen yan tinggi, memandang perlu mendirikan YBI, yang akan menjadi suatu yayasan yang dapat beroperasi dengan komitmen dan integritas yang tinggi.
Yayasan Betania Indonesia (YBI) sebelumnya bernama Yayasan Betania Irian Jaya, karena didirikan di Jayapura pada tanggal 3 September 1990, dan berpusat di Irian Jaya. Oleh karena pengembangan lokasi pelayanan dan kelompok sasaran yang menjangkau provinsi lainnya seperti : Maluku, Sulawesi tengah, dan NTT, dengan perwakilan di Jakarta, maka pada tahun 1999, nama "Yayasan Betania Irian Jaya" diubah menjadi "Yayasan Betani Indonesia" dengan perubahan Akte pada tanggal 3 September 1996 dengan bertambah beberapa bidang kegiatan.
Yayasan Betaniah Indonesia berkomitmen untuk menjangkau masyrakat yang terabaikan oleh kasih Tuhan, beberapa komitmen lain untuk membangun masyarakat seperti :
1. Pendidikan Formal : Sekolah Betani
- Pendidikan Formal : PAUD - SMA
- Pendidikan Informal : Literasi Anak & Dewasa
- Pendidikan dua bahasa
2. Kesehatan
- Konsultasi Kesehatan
- Imunisasi
- Pengkaderan Medis
- Konseling dan Seminar HIV/AIDS
3. Penerjemahan Alkitab dalam beberapa suku bahasa di Papua
